RefWorks y EndNote Online son gratuitos para los usuarios de la Universidad de Deusto.
Hay otros gestores como Zotero, Mendeley y JabRef que son totalmente gratuitos.
RefWorks y EndNote Online no necesitan ninguna instalación y por lo tanto se pueden consultar desde cualquier ordenador con conexión a internet.
Por el contrario Zotero, Mendeley y JabRef necesitan instalación en cada ordenador.
Zotero, Mendeley y JabRef almacenan todas las referencias en el ordenador y se puede acceder a ellas sin estar conectado a internet. Zotero, concretamente, almacena tu Base de Datos en tu perfil de usuario de Firefox.
RefWorks permite vincular una cuenta con Dropbox, lo que permite almacenar las referencias y documentos en una ubicación en la nube o en un ordenador.
En el caso de EndNote Online, al ser aplicación web, no es posible.
Tanto RefWorks como Mendeley o EndNote Online disponen de complementos que una vez instalados permiten exportar referencias desde páginas web.
En Zotero la exportación siempre es desde el navegador web.
EndNote Online y Zotero permiten adjuntar archivos a las referencias exportadas.
RefWorks y Mendeley permiten importar referencias y su archivo adjunto en un mismo paso. Además, también permite crear anotaciones en los documentos y permitir que otras personas los comenten.
Zotero, RefWorks y Mendeley, por su parte, permiten organizar los PDF adjuntados así como indizarlos para buscarlos y citarlos fácilmente.
Una de las principales funciones de los gestores bibliográficos es la de poder utilizar las referencias para citar en un documento. Cada gestor bibliográfico tiene su propio complemento para procesadores de texto, generalmente para Word, que permite insertar citas de las referencias que tenemos guardadas en nuestro gestor bibliográfico.
RefWorks también permite insertar citas y bibliografías en documentos de Google Docs.
En RefWorks, EndNote Online y Zotero se pueden crear bibliografías sueltas de las referencias.
En Mendeley y JabRef no es posible.
Hay gestores bibliográficos que permiten editar y crear formatos bibliográficos: RefWorks, Zotero y Mendeley.
En cambio EndNote Online y JabRef no disponen de esa opción.
En RefWorks es posible compartir tanto referencias como documentos adjuntos, y anotarlos y comentarlos conjuntamente con aquellos usuarios que tengan permiso.
En Zotero se puede utilizar Zotero Groups para compartir fácilmente tus referencias con otros usuarios pública o privadamente.
Mendeley permite también compartir referencias creando grupos públicos, por invitación o privados, que pueden compartir trabajos y notas entre sí.
EndNote Online proporciona una herramienta para grupos que permite compartir referencias con otros usuarios de EndNote.